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分子診斷標準品具備的3個特征
點擊次數:502 發布時間:2022-08-14
分子診斷標準品的性能驗證的內容包括:精密度或重復性(定性和定量)、準確度(定性為方法學比較或與標準樣品盤比較)、線性(定量)、可報告范圍(定量)、檢出限(定性)、參考區間(定量)、抗干擾能力等。分子診斷的流程具有多個環節,從樣品樣本提取到變異檢測,每個環節都存在不確定因素和不可規避的系統誤差,這使得分析結果存在假陽性或假陰性的可能。因此需要標準品,來檢測與校對分析體系的準確性。
分子診斷標準品應該具備以下3個特征:
1.代表性。標準品需要與待測樣品在基因遺傳背景、細胞類型、組織類型和處理方式等方面高度相似,才能模擬待測樣品的檢測過程,以分析實驗體系的精準度和判別待測樣品結果。
2.可量化。標準品需要具備突變頻率階梯性,將編輯細胞與野生型細胞以不同比例混合,用于模擬不同疾病或檢測系統的檢測上下限。
3.持續穩定。標準品需要能持續且穩定生產。
在PCR檢測變異的流程中,可以用標準品來驗證試劑盒的提取效率、變異檢測的準確度、試劑盒的靈敏度等。在核酸提取步驟中,樣本經過不同的處理往往對核酸提取率有影響,比如經過福爾馬林、石蠟包埋等處理等。如果存在與患者樣本處理方式、材質、細胞復雜性和結構特性相似的標準品,例如FFPE標準品,則可以在提取環節中得知提取效率。如果更換提取體系時,只要使用相同的標準品,還可以比較不同提取體系的提取效率。同理,標準品在文庫構建階段和測序階段也發揮著相同的作用,用于確定建庫效率和測序質量。
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